EMS est né à Barcelone en 1995 de l'initiative d'ingénieurs-océanographes appartenant au groupe d'océanographie physique du centre de recherche Institut de Ciències del Mar (ICM Barcelona) : Miguel Moll et Agustí Julià (1940-2009).

Au fil des années, EMS est parvenu à signer des contrats de représentation avec les fabricants leader d'instrumentation océanographique.

Miguel et Agustí ont commencé l'activité dans un petit appartement de Barcelone, en fabricant des solutions sur mesure pour divers clients océanographes. Au fil des années, EMS est parvenu à signer des contrats de représentation avec les fabricants leader d'instrumentation océanographique, jusqu'alors difficilement accessible localement, en privilégiant offrir un service technique efficace et compétitif, ce qui renforça l'activité et attira de nouveaux "collaborateurs" et clients. L'entreprise a continué à se développer et compte actuellement avec de grandes installations à Barcelone (bureaux et ateliers). En 2006 EMS a ouvert une filiale en France (EMS S.A.R.L.) dont le siège est situé à Paris (bureaux administratifs) afin de faciliter l'activité sur le territoire français. Les bureaux commerciaux et le service technique sont à Barcelone.